WRKY转录因子家族通常识别并结合一个特异的DNA序列模式,这个模式被称作W-box。W-box序列的核心共识序列是"T/TTGAC(C/T)",其中"T/TTGAC"是核心识别部分,后面跟着的是任意核苷酸,通常是一个胞嘧啶(C)或胸腺嘧啶(T)。
在不同的植物基因组中,这个序列可能有些微小的变化,但大多数情况下,WRKY转录因子识别的序列都包含"TTGAC"这一基本模式。这个模式的变异形式可以是"TTGACC"、"TTGACT",或者是这两个序列的反向互补序列"AGTCAA"等。
WRKY转录因子与W-box的结合对于许多植物基因的调控至关重要,尤其是在响应病原攻击和逆境胁迫的过程中。通过这种结合,WRKY转录因子可以激活或抑制下游基因的表达,从而影响植物的生理反应和适应性。