在PCR(聚合酶链反应)中,可以作为模板的物质包括:
双链DNA(dsDNA):传统PCR最常见的模板是双链DNA。 从基因组到纯化的PCR产物,只要是含有所需序列的双链DNA都可以作为模板。
单链DNA(ssDNA):某些情况下,也可以使用单链DNA作为模板,尤其是对于制备特定方向的扩增或反转录后的PCR。
RNA(病毒RNA或总RNA提取物):通过反转录成cDNA后,RNA也可以被用作PCR模板。这种应用常见于扩增RNA病毒的遗传物质或真核生物表达的mRNA。
全基因组提取物:直接从不纯化的细胞提取物或组织匀浆中提取的基因组DNA。
质粒DNA(Plasmids):质粒DNA由于其环状结构且含有抗生素抗性基因而被广泛用作克隆和转基因实验中的模板。
噬菌体DNA:一些噬菌体中含有外来基因,可作为特定的模板。
古细菌DNA:古菌质粒或其他形式的古细菌DNA也可以用于PCR。
病原体DNA:包括细菌、病毒在内的病原体DNA提取后常用作检测和诊断的目的。
环境样本DNA:环境DNA(eDNA)是指取自环境中的无细胞DNA碎片(如水体、土壤),可以用于监测和分析环境中的微生物组成。
cDNA合成的产物:通过逆转录生成的互补DNA(cDNA)用于扩增系统中对应mRNA的基因片段。
选择哪种模板依赖于PCR实验的目的和可获取的材料。确定模板类型后,还需选择合适的引物来确保PCR的特异性和效率。