线路上设置移动停车信号的程序是：①驻站联络员抄录并确认作业调度命令，通知作业负责人；②作业负责人通知现场防护员按规定在作业地点设置移动停车信号；③按规定设置好移动停车信号后作业负责人发出作业命令。