革兰氏阴性菌的细胞壁结构包括:B、内壁层(肽聚糖层);D、外膜。外壁层一般指的是革兰氏阳性菌的较厚的肽聚糖层。E、磷壁酸是革兰氏阳性菌细胞壁的成分,不是革兰氏阴性菌的特有成分。所以,正确答案是B、C、D。
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